Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb6P70689 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb6P70689 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms