Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf3P70671 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf3P70671 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf3P70671 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf3P70671 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf3P70671 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf3P70671 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms