Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ldb1P70662 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ldb1P70662 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms