Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad50P70388 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad50P70388 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad50P70388 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad50P70388 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad50P70388 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad50P70388 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Rad50P70388 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad50P70388 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms