Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf11P70378 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgf11P70378 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf11P70378 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms