Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pitx1P70314 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitx1P70314 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitx1P70314 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms