Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54lP70270 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms