Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtgdrP70263 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtgdrP70263 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtgdrP70263 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms