Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crip1P63254 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crip1P63254 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crip1P63254 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crip1P63254 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crip1P63254 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip1P63254 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 924.6 ms