Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabrb3P63080 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms