Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf6P62331 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf6P62331 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arf6P62331 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms