Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpd2P62317 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd2P62317 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd2P62317 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms