Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan5P62080 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms