Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ActbP60710 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ActbP60710 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ActbP60710 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ActbP60710 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ActbP60710 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ActbP60710 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ActbP60710 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ActbP60710 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ActbP60710 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ActbP60710 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ActbP60710 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ActbP60710 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ActbP60710 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ActbP60710 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ActbP60710 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ActbP60710 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ActbP60710 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ActbP60710 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ActbP60710 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ActbP60710 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ActbP60710 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ActbP60710 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ActbP60710 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ActbP60710 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ActbP60710 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ActbP60710 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ActbP60710 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ActbP60710 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ActbP60710 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ActbP60710 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ActbP60710 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ActbP60710 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms