Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia3P60469 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfia3P60469 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms