Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtpaP58389 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpaP58389 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpaP58389 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpaP58389 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtpaP58389 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtpaP58389 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpaP58389 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms