Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpdl3bP58242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms