Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp4P57724 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcbp4P57724 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms