Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NcstnP57716 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NcstnP57716 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NcstnP57716 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
NcstnP57716 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NcstnP57716 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NcstnP57716 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NcstnP57716 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms