Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lim2P56563 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lim2P56563 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lim2P56563 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lim2P56563 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lim2P56563 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lim2P56563 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lim2P56563 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lim2P56563 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lim2P56563 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lim2P56563 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lim2P56563 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lim2P56563 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lim2P56563 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lim2P56563 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lim2P56563 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms