Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd38P56528 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd38P56528 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms