Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf5P56477 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf5P56477 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf5P56477 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf5P56477 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf5P56477 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms