Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GferP56213 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GferP56213 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GferP56213 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GferP56213 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GferP56213 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GferP56213 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GferP56213 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GferP56213 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GferP56213 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GferP56213 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GferP56213 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GferP56213 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GferP56213 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GferP56213 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GferP56213 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GferP56213 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GferP56213 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GferP56213 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GferP56213 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GferP56213 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GferP56213 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GferP56213 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GferP56213 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GferP56213 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GferP56213 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GferP56213 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GferP56213 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GferP56213 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GferP56213 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms