Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pex2P55098 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pex2P55098 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pex2P55098 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pex2P55098 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pex2P55098 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pex2P55098 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pex2P55098 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pex2P55098 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms