Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb4P54761 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb4P54761 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms