Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn3P51791 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn3P51791 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms