Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TspoP50637 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TspoP50637 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TspoP50637 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TspoP50637 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TspoP50637 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TspoP50637 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TspoP50637 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TspoP50637 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TspoP50637 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TspoP50637 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TspoP50637 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TspoP50637 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TspoP50637 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TspoP50637 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TspoP50637 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TspoP50637 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TspoP50637 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms