Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpbP50405 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SftpbP50405 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpbP50405 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpbP50405 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms