Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hnrnpa1P49312 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hnrnpa1P49312 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms