Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CitP49025 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CitP49025 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CitP49025 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CitP49025 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CitP49025 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CitP49025 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CitP49025 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CitP49025 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CitP49025 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CitP49025 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CitP49025 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CitP49025 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CitP49025 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CitP49025 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CitP49025 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CitP49025 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CitP49025 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CitP49025 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CitP49025 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CitP49025 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CitP49025 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CitP49025 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CitP49025 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CitP49025 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CitP49025 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CitP49025 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CitP49025 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CitP49025 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CitP49025 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CitP49025 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms