Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GastP48757 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GastP48757 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GastP48757 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GastP48757 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GastP48757 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GastP48757 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GastP48757 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GastP48757 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GastP48757 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GastP48757 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GastP48757 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GastP48757 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GastP48757 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GastP48757 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GastP48757 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GastP48757 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GastP48757 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GastP48757 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GastP48757 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1106 ms