Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcntP48725 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcntP48725 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcntP48725 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PcntP48725 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PcntP48725 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcntP48725 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcntP48725 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcntP48725 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcntP48725 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcntP48725 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcntP48725 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcntP48725 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcntP48725 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcntP48725 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcntP48725 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PcntP48725 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PcntP48725 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PcntP48725 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PcntP48725 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PcntP48725 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PcntP48725 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcntP48725 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcntP48725 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcntP48725 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcntP48725 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcntP48725 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcntP48725 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcntP48725 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcntP48725 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcntP48725 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcntP48725 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcntP48725 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcntP48725 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcntP48725 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcntP48725 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcntP48725 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1365.6 ms