Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igfbp6P47880 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Igfbp6P47880 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Igfbp6P47880 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms