Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg3P47867 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg3P47867 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg3P47867 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg3P47867 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg3P47867 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg3P47867 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg3P47867 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg3P47867 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg3P47867 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg3P47867 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scg3P47867 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg3P47867 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg3P47867 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms