Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfkmP47857 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfkmP47857 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfkmP47857 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfkmP47857 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfkmP47857 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfkmP47857 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfkmP47857 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfkmP47857 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfkmP47857 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PfkmP47857 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms