Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax9P47242 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax9P47242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms