Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc2P43407 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms