Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgavP43406 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgavP43406 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgavP43406 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgavP43406 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms