Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf6P43028 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdf6P43028 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms