Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tac1P41539 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tac1P41539 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tac1P41539 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tac1P41539 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tac1P41539 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 509.6 ms