Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VhlP40338 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VhlP40338 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VhlP40338 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VhlP40338 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VhlP40338 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VhlP40338 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VhlP40338 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VhlP40338 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VhlP40338 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VhlP40338 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms