Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ThpoP40226 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ThpoP40226 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ThpoP40226 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms