Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rfc1P35601 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc1P35601 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms