Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp4P35123 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp4P35123 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp4P35123 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp4P35123 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp4P35123 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp4P35123 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms