Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc1P34928 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms