Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2P34152 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2P34152 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms