Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola2P33611 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola2P33611 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola2P33611 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola2P33611 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola2P33611 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola2P33611 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola2P33611 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms