Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vcam1P29533 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms