Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp3P28862 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms