Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LoxP28301 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LoxP28301 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LoxP28301 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LoxP28301 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LoxP28301 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LoxP28301 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LoxP28301 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LoxP28301 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LoxP28301 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LoxP28301 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LoxP28301 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LoxP28301 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LoxP28301 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LoxP28301 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LoxP28301 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LoxP28301 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LoxP28301 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LoxP28301 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LoxP28301 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LoxP28301 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LoxP28301 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LoxP28301 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LoxP28301 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LoxP28301 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LoxP28301 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LoxP28301 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms